개인사업자가 종합소득세 신고 때 챙길 공제·감면

• 세액공제·감면국세청(관할 세무서) / 재정경제부

  기장세액공제(간편장부대상자가 복식부기로 신고할 때)

  매출이 작아 간편장부만 써도 되는 개인사업자가 복식부기 장부로 종합소득세를 신고하면, 사업소득에 해당하는 산출세액의 20%를 깎아 줍니다(한도 100만원).

  지원 내용

  종합소득 산출세액 중 복식부기 장부로 계산한 사업소득 비율만큼의 20% 세액공제, 한도 100만원

  대상

  간편장부대상자인 개인사업자: 그해 새로 사업을 시작했거나, 직전 연도 수입금액이 도소매·농림어업 등 3억원, 제조·음식숙박·건설·운수·정보통신 등 1억5천만원, 부동산임대·전문서비스·교육·보건·개인서비스 등 7천5백만원 미만

  신청 시기

  종합소득세 확정신고 때(매년 5월, 성실신고 확인 대상은 6월)

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• 세액공제·감면국세청(관할 세무서) / 재정경제부

  성실신고 확인비용 세액공제

  매출이 업종별 기준 이상이라 세무사에게 '성실신고 확인'을 받아 종합소득세를 신고하는 개인사업자는, 확인에 쓴 비용의 60%를 종합소득세에서 공제받을 수 있습니다(한도 120만원).

  지원 내용

  성실신고 확인에 직접 쓴 비용의 60% 세액공제(개인사업자 한도 120만원). 사업소득(부동산임대업 포함)에 대한 소득세에서만 공제. 성실신고확인대상 법인은 같은 조문으로 법인세에서 공제(한도 150만원, 아래 참고)

  대상

  해당 연도 수입금액이 업종별 기준 이상인 성실신고확인대상 개인사업자: 도소매·농림어업 등 15억원, 제조·음식숙박·건설·운수·정보통신 등 7억5천만원, 부동산임대·전문서비스·교육·보건·개인서비스 등 5억원

  신청 시기

  종합소득세 신고 때(성실신고확인서를 내는 사업자는 다음 해 6월 30일까지 신고)

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• 세액공제·감면국세청(관할 세무서) / 재정경제부

  성실사업자 의료비·교육비·월세 세액공제

  연말정산을 하지 않는 개인사업자도 성실신고 확인을 받거나 '성실사업자' 요건을 갖추면, 본인·가족 의료비와 교육비, 월세 일부를 종합소득세에서 공제받을 수 있습니다.

  지원 내용

  의료비·교육비 지출액의 15%(미숙아·선천성이상아 의료비 20%, 난임시술비 30%) 세액공제 / 월세: 종합소득금액 7천만원 이하이면 지급액의 15%(4천5백만원 이하 17%), 월세 연 1천만원까지 / 2026년 12월 31일이 속하는 과세연도 지출분까지

  대상

  ①성실신고확인서를 제출한 성실신고확인대상 개인사업자, 또는 ②소득세법상 성실사업자 중 수입금액이 직전 3년 평균의 50% 초과, 과세기간 시작일 현재 2년 이상 계속 사업, 국세 체납·조세범 처벌·세금계산서 위반 없음 등 요건을 모두 갖춘 개인사업자

  신청 시기

  종합소득세 신고 때(2026년 지출분은 2027년 5~6월 신고까지 적용, 이후 연장 여부는 세법개정 확인 필요)

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• 세액공제·감면국세청(관할 세무서) / 재정경제부

  신용카드매출전표 등 발행세액공제(부가가치세)

  소매·음식점·숙박업처럼 주로 소비자를 상대하는 개인사업자가 카드·현금영수증으로 매출을 받으면, 그 금액의 일정 비율을 부가가치세 납부세액에서 빼 줍니다.

  지원 내용

  신용카드매출전표·현금영수증 등 발급금액의 1.3%(2026년 12월 31일까지, 이후 1%) 부가가치세 납부세액 공제, 연간 한도 1천만원(2026년 12월 31일까지, 이후 500만원). 납부할 세액을 넘는 부분은 없어짐

  대상

  소매업·음식점업·숙박업 등 주로 소비자를 상대하는 업종의 개인사업자(직전 연도 사업장별 공급가액 10억원 초과자 제외)와 영수증 발급 대상 간이과세자

  신청 시기

  부가가치세 신고 때(일반과세자 1월·7월 확정신고, 간이과세자 1월)

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• 세액공제·감면국세청(관할 세무서)

  중소기업 결손금 소급공제에 따른 종합소득세 환급

  올해 사업에서 적자(결손금)가 난 중소기업 개인사업자는, 작년 사업소득에 낸 종합소득세 중 일부를 돌려받을 수 있습니다. 종합소득세 신고기한 안에 신청해야 합니다.

  지원 내용

  직전 과세기간 사업소득에 부과된 종합소득 결정세액을 한도로 법정 계산식에 따른 결손금 소급공제세액 환급(금액은 개별 계산)

  대상

  조특법상 중소기업을 경영하는 개인사업자로 올해 사업소득에서 결손금(부동산임대업 결손금 제외)이 생기고, 올해와 작년 종합소득세를 모두 기한 안에 신고한 경우

  신청 시기

  결손금이 생긴 해의 종합소득세 신고기한까지(보통 다음 해 5월 31일, 성실신고 확인 대상은 6월 30일)

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• 세액공제·감면국세청(관할 세무서) / 재정경제부(세법 소관)

  중소기업에 대한 특별세액감면

  감면 업종을 하는 중소기업이 사업장에서 번 소득에 대한 세금(법인은 법인세, 개인사업자는 종합소득세) 일부를 매년 깎아 주는 제도입니다. 회사 규모(소기업/중기업), 업종, 수도권 여부에 따라 감면율이 다릅니다.

  지원 내용

  법인세·종합소득세(사업소득분) 감면(세액감면): 소기업 도매·소매업·의료업 10%, 소기업 수도권 그 밖의 감면업종 20%, 소기업 수도권 밖 30%, 중기업 수도권 밖 도매업등 5%, 중기업 수도권 일반 서적 출판업 10%, 중기업 수도권 밖 그 밖의 감면업종 15% / 감면한도 1억원(상시근로자 감소 시 1명당 5백만원씩 차감)

  대상

  조세특례제한법상 중소기업 중 감면 업종(제조·건설·도소매·정보서비스·연구개발·전문디자인 등 법 제7조 제1항 제1호 열거 업종)을 경영하는 기업

  신청 시기

  매년 법인세 신고 때, 개인사업자는 종합소득세 신고 때(2028년 12월 31일 이전에 끝나는 과세연도까지)

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• 세액공제·감면국세청(관할 세무서) / 재정경제부

  창업중소기업 등에 대한 세액감면

  정해진 업종으로 새로 창업한 중소기업(청년 창업, 창업 후 3년 안에 벤처확인을 받은 기업 포함)의 법인세(개인사업자는 종합소득세)를 최초 소득 발생 연도부터 5년간 깎아 주는 제도입니다. 창업 지역과 대표 나이에 따라 감면율이 다릅니다.

  지원 내용

  법인세·종합소득세 감면(5년간). 2026.1.1 이후 창업: 청년창업 수도권 밖·수도권 인구감소지역 100%, 수도권(과밀억제권역·인구감소지역 제외) 청년 75%, 과밀억제권역 청년 및 수도권 밖 일반 창업 50%, 수도권(과밀억제권역·인구감소지역 제외) 일반 창업 25% / 창업벤처중소기업 50% / 연 감면세액 합계 5억원 초과분은 감면 안 함

  대상

  2027.12.31 이전에 광업·제조·건설·통신판매·물류·음식점·정보통신·전문과학기술서비스(일부 제외)·사업지원서비스 등 법정 업종으로 창업한 중소기업

  신청 시기

  창업 후 최초 소득 발생 과세연도(소득이 없으면 5년째 과세연도)부터 매년 법인세 신고 때, 개인사업자는 종합소득세 신고 때

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• 세액공제·감면국세청(관할 세무서) / 재정경제부

  통합고용세액공제(기본공제)

  상시근로자 수가 늘어난 기업의 법인세(개인사업자는 종합소득세)를 늘어난 인원 1명당 정해진 금액만큼 깎아 줍니다. 2026년 과세연도부터 개편되어, 늘어난 고용을 2~3년 유지하면 2·3년차 공제액이 더 커집니다.

  지원 내용

  법인세·종합소득세 세액공제(중소기업, 1인당): 청년등(청년 정규직·장애인·60세 이상·경력단절·북한이탈주민) 직전연도 대비 증가 700만원(수도권 밖 1,000만원), 전전연도 대비 1,600만원(1,900만원), 전전전연도 대비 1,700만원(2,000만원) / 그 외 근로자 400만원(700만원), 900만원(1,200만원), 1,000만원(1,300만원)

  대상

  소비성서비스업(호텔·여관업, 유흥주점 등)을 제외한 기업으로 상시근로자 수가 직전 3개 과세연도 중 1개 이상보다 증가한 기업(중소기업은 최소 증가인원 기준 없음)

  신청 시기

  2026년 12월 31일이 속하는 과세연도부터 2028년 12월 31일이 속하는 과세연도까지, 매년 법인세 신고 때(개인사업자는 종합소득세 신고 때)

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• 세액공제·감면중소벤처기업부 / 중소기업중앙회

  노란우산(소기업·소상공인공제)

  소기업·소상공인 대표자가 매달 부금을 넣어 폐업·노령 등에 대비하는 공적 공제입니다. 납입액은 소득공제되고 연 복리로 적립됩니다. 법인 대표도 가입할 수 있습니다.

  지원 내용

  납입부금 연간 최대 600만원 소득공제(사업소득금액, 법인대표는 근로소득금액 기준: 4천만원 이하 600만원 / 4천만~6천만원 500만원 / 6천만~1억원(법인대표 6,625만원 이하) 400만원 / 1억원 초과(개인) 200만원), 연 단위 복리 적립

  대상

  소기업·소상공인 범위(업종별 3년 평균매출 기준)에 해당하는 개인사업자 또는 법인의 대표자

  신청 시기

  연중 상시

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• 지원금근로복지공단(가입) / 중소벤처기업부·소상공인시장진흥공단(보험료 지원)

  자영업자 고용보험 가입과 소상공인 고용보험료 지원

  직원이 없거나 50명 미만인 사장님도 본인 이름으로 고용보험에 가입할 수 있습니다. 소상공인이 가입하면 보험료 일부를 정부가 최대 5년간 지원(환급)합니다.

  지원 내용

  자영업자 고용보험 임의가입(비자발적 폐업 시 실업급여·직업훈련 지원 대상) / 소상공인 고용보험료 지원: 낸 보험료의 일부를 기준보수 1~2등급 80%, 3~4등급 60%, 5~7등급 50% 비율로 최대 5년(60개월)까지 환급

  대상

  근로자가 없거나 50명 미만을 쓰는 자영업자(개인사업장은 사업주, 법인은 대표이사). 사업자등록을 하고 실제 사업 중이어야 하며 부동산임대업만 하는 경우 등은 제외. 보험료 지원은 자영업자 고용보험에 가입한 소상공인

  신청 시기

  고용보험 가입은 연중 / 2026년 보험료 지원은 2026.1.1부터 예산 소진 시까지(지원 신청한 달부터 지원, 이전 보험료 소급 없음)

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• 교육·인증·바우처국세청(전국 세무서 납세자보호담당관실)

  영세납세자지원단(나눔세무사·나눔회계사 무료 세무자문)

  세무대리인이 없는 영세 개인사업자와 영세 중소법인이 종합소득세·법인세·부가가치세·원천세 등을 나눔세무사·회계사에게 무료로 상담받을 수 있습니다. 창업자 멘토링, 폐업자 멘토링도 있습니다.

  지원 내용

  무료 세무자문(신고대리는 하지 않음), 창업자·폐업자 멘토링, 찾아가는 현장상담

  대상

  세무대리인이 없는 영세 개인사업자, 영세중소법인(수입금액 3억원·자산총액 5억원·자본금 5천만원 이하 비상장·비계열 영리내국법인), 사회적 경제기업, 장애인 사업장

  신청 시기

  연중 상시

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• 교육·인증·바우처국세청(관할 세무서)

  국세 납부기한 등의 연장·납부고지 유예

  사업에 큰 손실이 났거나 부도·도산 우려가 있는 등 세금을 기한까지 내기 어려우면 세무서에 신청해 납부기한을 늦추거나 나눠 낼 수 있습니다.

  지원 내용

  납부기한 연장 또는 납부고지 유예(분할납부 포함), 원칙적으로 9개월 이내

  대상

  재난·도난으로 재산 손실, 사업에 현저한 손실이나 부도·도산 우려 등으로 국세를 기한 내 납부하기 어려운 납세자

  신청 시기

  납부기한 만료일 전(만료 10일 전까지 신청하면 10일 내 미통지 시 승인 간주)

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자주 묻는 질문

Q. 개인사업자도 법인처럼 고용 세액공제를 받나요?

통합고용세액공제 등 조세특례제한법의 고용 공제는 개인사업자의 종합소득세에도 적용됩니다. 상시근로자 수 계산 방법은 제도 화면에서 확인하세요.

Q. 노란우산공제는 법인 대표도 가입할 수 있나요?

소기업·소상공인 범위에 해당하는 개인사업자와 법인 대표자가 가입할 수 있습니다. 법인 대표자는 소득공제에 소득 요건이 있으니 제도 화면을 확인하세요.

Q. 언제 법인전환을 검토해야 하나요?

매출이 성실신고확인 기준에 가까워지거나, 이익을 회사에 남겨 재투자하려 하거나, 투자 유치·가업승계를 계획할 때 검토합니다. 법인전환 가이드에 방법별 세금 처리를 정리했습니다.